Thứ hai, 25/11/2019 00:30
Số 11 năm 20197 - 11Download

Khảo sát sự đa dạng di truyền vùng D-loop hệ gen ty thể ở ba nhóm tộc người: Hà Nhì, Phù Lá, Si La

Nguyễn Văn Phòng1, 2, Nguyễn Thy Ngọc1, 3, Nguyễn Doãn Tình1 , Nguyễn Thùy Dương1, 2, Nông Văn Hải1, 2*

1 Viện Nghiên cứu Hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam

2 Học viện Khoa học và Công nghệ, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam

3 Trường Đại học Khoa học và Công nghệ Hà Nội, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam

Ngày nhận bài: 25/03/2019; ngày chuyển phản biện: 28/03/2019; ngày nhận phản biện: 24/04/2019; ngày chấp nhận đăng: 29/04/2019

Tóm tắt:

Nghiên cứu này tập trung xác định các đa hình nucleotide thuộc vùng điều khiển D-loop, hệ gen ty thể của các cá thể thuộc ba tộc người cùng nhóm ngữ hệ Tạng Miến, sinh sống ở địa bàn hai tỉnh Điện Biên, Lai Châu là Hà Nhì, Phù Lá và Si La. Bằng phương pháp giải trình tự gen Sanger đã xác định được 91 điểm đa hình khác biệt so với trình tự hệ gen ty thể tham chiếu chuẩn rCRS mã số NC_012920.1. Phân tích thống kê bằng kiểm định Fisher exact (2 phía) cho thấy có 14 đa hình có sự khác biệt có ý nghĩa thống kê (p<0,05) giữa các tộc người, trong đó có 4 đa hình chỉ xuất hiện ở tộc người Phù Lá gồm T16086C, C16167T, A16203G và A16318G. Các phân tích sâu hơn về khoảng cách di truyền cho thấy khoảng cách di truyền trung bình giữa các cá thể thuộc các tộc người Hà Nhì, Phù Lá, Si La lần lượt là 0,01; 0,01 và 0,008. Khoảng cách di truyền giữa các nhóm cá thể thuộc tộc người Hà Nhì - Phù Lá, Hà Nhì - Si La và Phù Lá - Si La lần lượt là 0,011; 0,0105 và 0,0106. Những số liệu này sẽ là cơ sở dữ liệu góp phần vào nghiên cứu đa dạng di truyền và nguồn gốc lịch sử của các tộc người Việt Nam

Từ khóa:

D-loop, đa dạng di truyền, Hà Nhì, hệ gen ty thể, Phù Lá, Si La

Chỉ số phân loại:
1.6

Study of genetic polymorphisms in d-loop region of the mitochondrial genomes from three ethnic groups: ha nhi, phu la, si la

Van Phong Nguyen1, 2, Thy Ngoc Nguyen1, 3, Doan Tinh Nguyen1 , Thuy Duong Nguyen1, 2, Van Hai Nong1, 2

1 Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology

2 Graduate University of Science and Technology, Vietnam Academy of Science and Technology

3 University of Science and Technology of Hanoi, Vietnam Academy of Science and Technology

Received: 25 March 2019; accepted: 29 April 2019

Abstract:

Our study aimed to identify the genetic polymorephism in the D-loop region of human mitochondrial genome of three ethnic minority groups namely Ha Nhi, Phu La and Si La. These ethnic minority groups belonging to the Sino-Tibetan language family live in Northwestern Vietnam provinces: Dien Bien and Lai Chau. Using the Sanger sequencing, we identified 91 variants in the mtDNA of individuals from three ethnics compared to the reference mtDNA rCRS NC_012920.1. Statistical analysis was performed using the Fisher exact test (2 sides). The result showed that 14 genetic variants were significantly different among three ethnic groups (p<0.05). Among them, four genetic polymorphisms were detected only in the Phu La group, including T16086C, C16167T, A16203G, and A16318G. Further analysis indicated that the mean genetic distances between individuals in each ethnic group Ha Nhi, Phu La, and Si La were 0.01, 0.01, and 0.008, respectively. The genetic distances between ethnic groups were 0.011 (Ha Nhi - Phu La), 0.0105 (Ha Nhi - Si La), and 0.0106 (Phu La - Si La). These results contribute further data to the study of genetic variations and historical origins of the Vietnamese ethnic group

Keywords:

D-loop, genetic polymorephism, Ha Nhi, mitochondrial genome, Phu La, Si La

Classification number:
1.6
Lượt dowload: 662 Lượt xem: 1929

Đánh giá

X
(Di chuột vào ngôi sao để chọn điểm)
Chấm điểm